Отдел мониторинга и внутреннего контроля Андижанского филиала Ташкентского аграрного университета организован в целях выполнения намеченных задач в национальной программе подготовки кадров, нормативных документов и методических указаний учебно-образовательного процесса, также, контроля своевременного выполнения приказов и постановлений филиала.
Отдел “Мониторинг и внутренний контроль” ведет свою деятельность на основании положения, утвержденного 207-приказом министерства высшего и среднего специального образования республики Узбекистан от 29 августа 2001 года «Об осуществлении мониторинга внутренней инспекции и национальной программы подготовки кадров в высшем образовании», Устав Андижанского филиала Ташкентского аграрного университета и положения отдела. Отдел осуществляет мониторинг применения на производство национальной программы подготовки кадров. Также, осуществляет контроль выполнения учебных, учебно-образовательных, духовно-просветительских и воспитательных, научно-экспериментальных работ, дисциплину исполнения, переподготовки и переквалификации кадров. Ведет мониторинг выполнения постановления коллегиальных и научных советов, приказов министерства, университета, филиала и других нормативных документов. Отдел мониторинга и внутреннего контроля в своей деятельности непосредственно подчиняется директору филиала.